性能与验证边界

bwa-rust 的性能目标是提供清晰、内存安全、可调参的 Rust 单端比对基线，而不是在当前版本追求完全替代 BWA。

当前判断

项目	状态
微基准	cargo bench 覆盖 FM-index search、SMEM、SW、SA 构建等热点。
单端吞吐	支持 rayon read 级并行。
人类基因组生产验证	未宣称完成。
BWA bit-level 兼容	非目标。

本地运行

cargo bench

CI 不定时自动跑基准，因为 GitHub-hosted runner 噪声较大，且没有稳定基线趋势系统。性能相关变更应在本地或专用环境运行基准并记录对比条件。

正确性验证

cargo fmt --all -- --check
cargo clippy --all-targets --all-features -- -D warnings
cargo test --all-targets --all-features

真实数据测试位于 tests/real_data.rs，默认 ignored，需要显式准备数据和 feature 后运行。